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宏转录组测序

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技术简介



       宏转录组测序是以环境中全部微生物为研究对象,通过提取环境中整个微生物群落的总RNA,利用高通量测序测序技术进行大规模测序,通过生物信息学分析,研究微生物与环境、与宿主相互之间的关系,它摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制。高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点,能够显著加快微生物转录组学研究的进程,并且在鉴定低丰度的微生物群落及种类,挖掘更多基因资源方面具有非常大的优势。该技术常用来研究环境微生物的微生物-宿主互作、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物研究。相较于宏基因组,宏转录组能从转录水平研究复杂微生物群落变化,能更好的挖掘潜在的新基因、差异表达的基因及其功能以及代谢通路的构建。



技术优势



            1、无需对微生物进行分离培养,直接提取微生物群落总RNA;

            2、可同时鉴定几乎所有的微生物种类;

            3、信息分析全面,除了对物种信息挖掘,还能得到重要基因的表达丰度,差异变化等进行分析;

            4、可快速,高效,大样本的对多个群落进行分析。



样本要求



样品浓度 RNA ≥50ng/μl;样品总量 RNA ≥10μg



实验周期



50天



       生因生物分析团队已完成上千个项目的个性化数据分析,依托Illumina Hiseq 2000、Illumina Hiseq 2500、Illumina Hiseq 4000等测序平台,可为研究者提供多样化的测序服务和个性化的数据分析服务。多篇文献发表在Nature、Science、Cell等顶级期刊,平均影响因子达到6。


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