更多
相关文献
技术介绍
-
技术简介
宏转录组测序是以环境中全部微生物为研究对象，通过提取环境中整个微生物群落的总RNA，利用高通量测序测序技术进行大规模测序，通过生物信息学分析，研究微生物与环境、与宿主相互之间的关系，它摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制。高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点，能够显著加快微生物转录组学研究的进程，并且在鉴定低丰度的微生物群落及种类，挖掘更多基因资源方面具有非常大的优势。该技术常用来研究环境微生物的微生物-宿主互作、基因功能及代谢网络等，已广泛应用于微生物研究。相较于宏基因组，宏转录组能从转录水平研究复杂微生物群落变化，能更好的挖掘潜在的新基因、差异表达的基因及其功能以及代谢通路的构建。
技术优势
1、无需对微生物进行分离培养，直接提取微生物群落总RNA；
2、可同时鉴定几乎所有的微生物种类；
3、信息分析全面，除了对物种信息挖掘，还能得到重要基因的表达丰度，差异变化等进行分析；
4、可快速，高效，大样本的对多个群落进行分析。
样本要求
样品浓度 RNA ≥50ng/μl；样品总量 RNA ≥10μg
实验周期
50天
生因生物分析团队已完成上千个项目的个性化数据分析，依托Illumina Hiseq 2000、Illumina Hiseq 2500、Illumina Hiseq 4000等测序平台，可为研究者提供多样化的测序服务和个性化的数据分析服务。多篇文献发表在Nature、Science、Cell等顶级期刊，平均影响因子达到6。
