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RIP-seq

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技术简介


       RIP-seq是将RNA免疫共沉淀获得RNA采用高通量测序技术得到与蛋白质结合的所有RNA的序列信息,通过后续的数据分析可以获得与蛋白质相互作用的基因、RNA信息。是研究转录后调控网络动态过程、寻找miRNA的作用靶点等的有效手段。



技术优势


                            1、转录组覆盖广:与芯片相比,可在全转录组范围对蛋白结合位点进行筛选与鉴定;
                            2、高灵敏度:每个样本可获得数百万条的序列,可发现研究转录组上稀有的蛋白结合位点;
                            3、高精确率:可精确定位RNA与蛋白质结合位点;

                            4、定量范围广:高于6个数量级的动态检测范围,能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。



样本要求


RNA样品量大于10ng;浓度大于50ng/ul



实验周期



40天



       生因生物分析团队已完成上千个项目的个性化数据分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等测序平台,可为研究者提供多样化的测序和个性化的数据分析服务。多篇文献发表在Nature、Science、Cell等顶级期刊,平均影响因子达到6。


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