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深入分析膀胱癌中差异表达lncRNAs和circRNA的共同表达和ceRNA网络


研究背景


       膀胱癌是最常见的泌尿系统癌症,在不同的国家均具有较高的发病率和死亡率。目前膀胱癌已经是第七男性最常见的癌症。根据全球癌症统计每年约新增440,000名确诊的膀胱癌患者,并且有130,000名患者死于膀胱癌。膀胱癌在中国的发病率和死亡率在过去的几十年逐年上升,已经成为发病率最高的泌尿系统癌症和死亡率仅次于直肠癌的恶性癌症。人的基因组中大约有5%-10%的序列会被转录,其中约有10-20%是编码蛋白的RNA,其余80-90%是不编码蛋白的RNA。近年来越来越多的研究表明非编码转录本在癌症的发病和发育过程中起着非常重要的作用。


研究方法



对膀胱癌与癌旁的lncRNA、circRNA和mRNA进行高通量分析。



研究结果


1 A,B,C分别是lncRNAs,circRNAs,mRNAs的表达量聚类热图。






2 A:mRNA GO富集分析;B:mRNA PATHWAY富集分析;C:通路网络图。




3 A:上调circRNA来源基因的GO富集分析;B:下调circRNA来源基因的GO富集分析。





4 mRNA与lncRNA共表达网络分析。





5)ceRNA网络分析。




研究结论


      本研究发现了几种与膀胱癌发生发展相关的lncRNAs和circRNAs,可能成为临床诊断分子标志物。同时,有些lncRNAs、circRNAs分子可能用于膀胱癌的诊断和治疗,具有重要的生物学意义。



参考文献


Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in bladder carcinoma. [Oncotarget, 2016]



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