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真核有参转录组测序

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技术简介



       转录组测序是指将特定状态下的特定组织或细胞的所有mRNA提取,并进行建库测序,得到所有mRNA表达信息的一种技术手段。转录组测序能够动态反映基因的转录情况,与常规基因芯片不同的是,转录组除了能得到基因的表达量外,还能够得到转录本的可变剪切,融合基因,位点突变,同时能够发现未报道的新转录本。目前,该技术已经成为高通量获得基因表达情况的主要手段。转录组测序打破了物种限制,无需提前得到基因组信息,也无需设计探针,可获得任何物种的转录本信息。真核有参转录组测序,是将获得的序列直接比对到参考基因组上,进而进行后续分析。




数据分析


 

            基因表达水平分析

            差异基因表达分析    差异基因GO/KEGG分析    蛋白网络分析    基因共表达分析

            基因结构水平分析

            可变剪切分析    融合基因分析    Snp/InDel分析    新转录本预测





样本要求



细胞 ≥5×106个; 组织 ≥40mg; Total RNA ≥5ug



实验周期



30天



       生因生物分析团队已完成上千个项目的个性化数据分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等测序平台,可为研究者提供多样化的测序和个性化的数据分析服务。多篇文献发表在Nature、Science、Cell等顶级期刊,平均影响因子达到6。


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