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转录组测序揭示地黄与环烯醚萜合成相关的基因


研究背景


        大鼠常作为化学毒性及药物作用机理研究的模式生物,但我们对大鼠的各个器官、各个发育阶段的转录信息还不太了解。本研究使用转录组测序技术对大鼠各器官各阶段的320个样本进行测序分析。地黄是古代广泛使用的一种中草药,富含生物活性环烯醚萜。尽管具备巨大的药用性,我们对这种植物合成环烯醚萜相关的分子知识一无所知。为了研究它的基因组,并且研究与环烯醚萜相关的基因,我们进行了大规模的平行测序。


研究方法




研究结果



1 基因GO富集分析




2 基因PATHWAY富集分析。





研究结论


       生物信息学分析发现了一系列的基因与环烯醚萜合成相关。一些仅在萜类吲哚生物碱的植物中表达的基因的同源基因也被鉴定出来,这一发现说明,环烯醚萜合成途径II与途径I在其合成的早些阶段共享某些酶。使用qPCR对4种异戊烯转移酶进行定量分析发现它们也在地黄中发挥作用。本研究后续环烯醚萜合成研究提供了重要信息。



参考文献



Transcriptome Analysis Reveals Putative Genes Involved in Iridoid Biosynthesis in Rehmannia glutinosa. [International Journal of Molecular Sciences, 2012]


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