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全转录组测序

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数据分析



            1、miRNA分析

            piRNA、snRNA、snoRNA、rRNA、tRNA等注释    已知miRNA鉴定    未知miRNA鉴定    碱基偏好性,家族分析    差异表达分析    靶基因预测    靶基因GO/KEGG富集分析

            2、mRNA分析

            差异基因表达分析    差异基因GO/KEGG分析    蛋白网络分析    基因共表达分析

            3、lncRNA分析

            lncRNA差异表达分析    novel lncRNA鉴定    cis作用靶基因预测    trans作用靶基因预测    lncRNA序列保守性分析

            4、circRNA分析

            circRNA鉴定(多种算法)    差异circRNA表达分析    来源基因GO/PATHWAY分析    microRNA结合位点预测

            5、基因结构水平分析

            可变剪切分析    Snp/InDel分析






以上分析皆为标准分析,生因生物可根据具体项目、具体需求提供个性化分析。



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