今天是2020年10月14日 星期三,欢迎光临本站 

lncRNA测序

技术介绍       数据分析       经典案例       常见问题




技术简介



       长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA分子。近几年研究发现lncRNA能够与蛋白质、DNA、RNA等相互作用,参与多种生物学过程的调控,在肿瘤、疾病发生及机体发育过程中扮演着重要作用。

        长链非编码RNA测序(LncRNA Sequencing)是通过去除rRNA,构建链特异性文库,对mRNA及lncRNA进行高通量测序的一种技术,能够分析不同实验条件下mRNA及lncRNA的即时表达情况。该技术可以精确到单个核苷酸的分辨率,同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本,获得转录本的可变剪切,位点突变等信息,已成为lncRNA高通量鉴定和定量的主要手段。



数据分析



            mRNA表达水平分析

            基因差异表达分析    差异表达基因GO/KEGG分析    蛋白网络分析    基因共表达分析

            lncRNA表达水平分析

            lncRNA差异表达分析    novel lncRNA鉴定    cis作用靶基因预测    trans作用靶基因预测    lncRNA序列保守性分析

            基因结构水平分析

            可变剪切分析    融合基因分析    Snp/InDel分析


            技术路线:




样本要求



细胞 ≥5×106个;组织 ≥40mg;Total RNA ≥5ug




实验周期



35天




       生因生物分析团队已完成上千个项目的个性化数据分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等测序平台,可为研究者提供多样化的测序和个性化的数据分析服务。多篇文献发表在Nature、Science、Cell等顶级期刊,平均影响因子达到6。


在线咨询
咨询QQ咨询QQ
咨询电话:
400-966-5216

请扫描二维码添加客服微信

公众号

[向上]