首页
>
微生物测序
>
细菌基因组de novo测序
>
经典案例
更多
相关文献
经典案例
-
SMRT DNA测序鉴定空肠弯曲杆菌基因组限制性修饰图
研究背景
空肠弯曲杆菌是一种主要的人类肠胃炎致病菌。本研究分析了一株来自严重肠炎病人的F38011菌株，在基因组和蛋白质组的角度认识细菌的致病过程。
研究方法
研究结果
1 C. jejuni F38011菌株基因组图。1.69M染色体基因组，以DnaA起始，1613编码区域。
2 C. jejuni F38011菌株与NCTC11168基因组比较。A：ACT比较分析；B：两种菌株（PR1-PR7）比较分析。
3 C. jejuni F38011菌株甲基化分析发现5个主要的甲基化修饰。
4 C. jejuni F38011菌株蛋白质组分析。A：LC-MS/MS分析蛋白质种类；B：基因组UniProt预测485个酶。
研究结论
空肠弯曲杆菌F38011菌株长度为1,691,939bp,GC含量为30.5%。使用三代测序和限制性内切酶数据库分析F38011菌株基因组位点以及可能与DNA限制性修饰有关的酶。共发现5个甲基化修饰与基因组修饰有关。蛋白组学分析得到的多肽序列与推测的多肽序列相一致。本研究为分析空肠弯曲杆菌限制性修饰酶的精准功能奠定了基础。总之，本研究的的结果有利于我们理解空肠弯曲杆菌基因组、甲基化谱和编码能力。
参考文献
Analysis of the Campylobacter jejuni Genome by SMRT DNA Sequencing Identifies Restriction-Modification Motifs. [Plos One, 2015]
