经典案例
miRNA序列分析揭示弥漫大B细胞淋巴瘤病人不同的存活率
研究背景
弥漫大B细胞淋巴瘤是一种高死亡率疾病,约30%-40%的病人无法治愈。miRNAs能够削弱靶标的表达,为了鉴定弥漫大B细胞淋巴瘤miRNA组,作者对92个弥漫大B细胞淋巴瘤病人,15个良性中心母细胞冰冻样本进行miRNA测序,并用140个弥漫大B细胞淋巴瘤石蜡样本进行验证。
研究方法
研究结果
1 a:miRNA测序分析鉴定的小RNA种类,大多数为miRNA;b:候选新miRNA分子表达热图。
2 a,b:miRNA差异表达火山图。
3 c:差异表达miRNA热图
4 miRNA靶基因GO(生物学过程)富集分析
研究结论
鉴定和发现了许多miRNAs,其中有25个与预后明显相关,6个得到了验证。全面的测序分析进一步验证了以前的突变分析,揭示了一些淋巴瘤明显的调控网络。
参考文献
Comprehensive miRNA sequence analysis reveals survival differences in diffuse large B-cell lymphoma patients. [Genome Biology, 2015]